1、池塘的选择。进行石斑鱼种苗生产以面积1-3亩，沙泥质底，保水性好，不渗漏，池底平坦可干晒的池塘最好。但也可在10亩左右，基本可排干的池塘中进行。选择的池塘要求位于取水方便，盐度稳定，污染少的海区。另外，交通、电力、生活要便利，周边治安好。
2、清塘。目的是杀死对石斑鱼仔鱼有害的动物和争食对象，如野杂鱼、虾、蟹等，清塘一定要彻底。
清塘前一般要排干水，使塘底暴晒一段时间，然后注入海水20-30厘米，以晶体敌百虫、漂白粉和茶籽饼作为清塘药物，使用的敌百虫浓度为3ppm，漂白粉为40ppm，茶籽饼为25公斤/亩。如不能排干则选用带水清塘，但要将水位降到最低，以节省清塘药物。
清塘时间：使用敌百虫在投放早期仔鱼的前15天进行，洒药时间安排在晴天的上午9点到下午3点之间进行，准确计算水体，洒药后保持7天；漂白粉清塘可以随时进行，加水调成糊状全塘均匀泼洒。
3、肥水。目的是培养基础饵料生物，为早期仔鱼提供足够、适宜的生物饵料。时间安排在产卵的当天或是敌百虫清塘后一个星期或漂白粉清塘后第二天进行。用60-80目的滤水网袋扎住进水管口，进水60-80厘米，施肥培养水色。
肥料采用化肥，用量为尿素5公斤/亩，过磷酸钙1公斤/亩，溶解后全塘均匀泼洒；四天后根据水色决定是否追肥，追肥使用复合肥，用量视透明度大小而定。
检查浮游动物的种类和数量，特别是要检查适合仔鱼开口的饵料生物的数量，若较少，可接种轮虫入塘1-2个/升。