鳗鱼苗种培育就是把鳗苗养成10克以上鳗种的生产过程。这一阶段需要经过一级池、二级池、三级池等三种不同类型池塘的培育。鳗种是成鳗养殖的基础，鳗种的数量和质量直接影响成鳗养殖的好坏。因此，要发展养鳗生产，首先必须抓好鳗鱼苗种的培育。
为了保证鳗苗培育工作的顺利进行，除了做好上述一切准备工作外，还需抓好以下几个生产环节。
鳗苗放养时间由于鳗苗在水温15℃以上才能正式开始摄食与生长，所以露天池培育鳗鱼苗种，以自然水温达到13℃以上时放养较为适宜。这样，鳗苗经过短期暂养适应环境后，当水温上升时即可开食驯养。在福建、广东的鳗苗放养时间在3月初左右。
有加温条件或有温水供给的养鳗场，鳗苗的放养时间应尽量提早，这样可以延长饲养期，提高鳗种的产量和质量。
鳗苗放养密度由于养殖方式不同，鳗苗的放养密度也各不相同。一般止水式池放养密度以150克-300克/平方米，流水池以500克-1000克/平方米为宜。以低密度放养成长较快，成活率高。
鳗苗对环境的适应鳗苗经长途运输，处于疲劳状态，加上运苗容器内温度与池水温度差距过大（特别是加温培育池），故需有一个适应过程，具体做法是：将鳗苗箱置于池边，逐渐用池水淋鳗苗箱，待鳗苗体温接近池水水温（一般不相差5℃）时才将其放入事先置于池中的网箱内；如果用尼龙袋充氧运输，可先将尼龙袋连苗放入池中，待袋温接近池水温度时再拆袋将鳗苗放入网箱内。鳗苗一般暂养0.5小时-1小时（开增氧机），待活动正常后撇除死苗、污物，分别过秤、计数放入各个鳗苗培育池内。
鳗苗的计数和过秤为了控制鳗苗的放养密度，在放养时必须计数，算出每个一级池放养的重量、规格和尾数。具体做法是：先将网箱内的鳗苗轻轻搅匀，然后随机取样2次-4次，每次称取50克，放在鳗苗捞海中用小碗或小勺过数，然后求出平均规格。最后算出每千克鳗苗尾数，从而得出平均规格。
鳗苗消毒鳗苗体质娇嫩，在采捕、暂养和运输中容易擦伤而感染水霉菌和细菌性疾病。因此，在放养时必须进行消毒。消毒方法为药浴，一种是用容器进行药浴，一种是全池泼洒药浴。
1．消毒时间：容器内药浴在鳗苗下池前进行；全池泼洒消毒在鳗苗下池后的当天傍晚进行。
2．消毒药物与浓度：常用的药物主要有食盐和次甲基蓝等。
3．消毒步骤与方法：用容器药浴时，一般在大水缸中进行，故又称缸浴。具体做法是，先在缸内盛清水300千克-400千克，然后按药物用量比例，先溶化在少量水中再倒入缸内，并开启曝气机进行曝气，不断搅动水，使药液均匀分布，然后称取5千克左右鳗苗连篰一起浸入药液中药浴10分钟-15分钟后，即可取出鳗苗放养。全池泼洒药浴在傍晚进行，把药物溶解后直接泼洒在一级池中，开增氧机搅水，使药液均匀分布。