鱼粉粗蛋白质含量很高，必需氨基酸含量全面，富含植物性蛋白质饲料缺乏的蛋氨酸、赖氨酸、色氨酸，还含有促进畜禽生长的核苷酸、活性小肽、牛磺酸等“生长因子”，可用于补充蛋白质、调节日粮氨基酸平衡，是养殖业最佳的蛋白质饲料，深受养殖户钟爱。尽管鱼粉优点很多，但也有明显的缺陷，养殖户必须充分了解，避免造成不应有的损失。1.价格高。鱼粉的市场价格很高，是影响日粮成本的重要组分。从经济效益角度考虑，鱼粉用量需严格控制。在肉鸡、蛋鸡日粮中，鱼粉用量以2%-5%为宜。2.易自燃。鱼粉中的脂肪在氧化过程中，会释放出大量热量；鱼粉中的磷被化学分解后，可释放出单质磷，单质磷燃点很低。所以，鱼粉保存不善，很容易发生自燃现象。3.易变质。鱼粉中含有组胺及其化合物，容易引起家禽肌胃糜烂。特别是变质的鱼粉，组胺含量更高。组胺在鸡饲料中占0.4%，就可以引起典型的肌胃糜烂，而劣质鱼粉中组胺含量可高达5%以上。鱼粉腐败后会产生腐胺、尸胺等生物胺，还有醛、酮、烃类等物质，这些物质既影响饲料适口性，也会对动物产生毒害。4.易污染。如果加工方法不当或者运输、保存不善，鱼粉容易被大肠杆菌、沙门氏菌、肉毒梭菌、蜡样芽孢杆菌、黄曲霉菌等多种微生物污染，危害动物健康，甚至导致死亡。5.易中毒。鱼粉含有一定盐分，进口鱼粉含盐量为1.5%-2.5%，国产鱼粉含盐量为4%-5%，但受原料、加工工艺等因素影响，有的鱼粉含盐量可能会高达15%-20%。如果配制饲料时忽视了鱼粉中的含盐量，就可能导致畜禽中毒，尤其是雏鸡，很容易引起死亡。6.易掺假。鱼粉价格高、利润大，不法商贩常常在鱼粉中掺假或以次充好而获取暴利。最常见的是掺入饼粕类饲料和具有强烈鱼腥味的添加剂。养殖户必须注意鉴别鱼粉的品质，防止因掺假、以次充好等造成损失。7.易串味。用鱼粉作饲料，易使畜禽产品沾染不良气味。劣质鱼粉的腥臭、腐臭或哈喇气味，既影响饲料的适口性和营养价值，也容易影响产品的质量。
